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一、虫害的发生
近年来，轮叶黑藻收到虫害的威胁越来越大，如线虫、卷叶虫、叮叮虫等，无一不危害着轮叶黑藻的健康。每年4～8月份，会连续发生不同种类的虫害，被虫危害的水草表现为叶子不完整，有被咬过的痕迹，新长出来的草的心头很快就会被吃掉，使得水草生长受到抑制。
应对措施：
如发现有虫危害水草，直接用药杀灭，危害严重的可以杀虫两次。（一定注意杀虫剂的选择）
二、龙虾的危害
大部分蟹塘都存在龙虾过多的现象，当龙虾繁殖生长起来以后，龙虾的存塘数量无法估计，饵料的投喂不足以满足虾蟹同时摄食，导致虾蟹大量夹草，造成的危害往往是毁灭性的。
应对措施：
针对龙虾过多的河蟹池塘，首先增加饵料投喂，如果大量投喂仍然不见很好的效果，可以使用驱赶龙虾的药物，将龙虾驱赶到边上，使用大量的地笼一次性把大部分龙虾捕起来。
三、野杂鱼的危害
由于泥鳅、鲫鱼等野杂鱼导致蟹塘水体持续浑浊，透明度低，影响水草的光合作用，同时水草叶面容易附着污垢，阻碍了水草的生长。
应对措施：使用颗粒较小的浮性的饲料伴阿斯曼，下午三到四点的时间全池投喂，由于虾蟹不会吃到，只有泥鳅、鲫鱼等野杂鱼会吃到，可以有效杀死大部分野杂鱼。
四、水草活力不好
草上泥垢多，时间长了会导致青苔和纤毛虫寄生在水草表面。进入5、6月份，部分水草开始进入换季阶段，水草开花、活力降低，此时如果赶上水质不够清澈，水草上的泥垢会越来越多，时间长了导致水草腐烂死亡，此种情况是水草泥垢恶化的初期，一般处理起来还比较容易。
但是，如果处理不当，延误了处理的最佳时期，慢慢的就会有青苔和纤毛虫寄生在上面，情况严重的还会寄生一些不常见的蠕虫和原虫，严重影响草的长势和活力。
应对措施：
对于水草上泥垢初期，分解草上泥垢，杀灭部分附着在水草表面的细菌，减少表面粘稠度，促进泥垢脱落，进一步把水草表面泥垢分解、清除，促进有机质转化分解。
养殖户在壮草时，喜欢选择复合肥作为肥料，这样会让水草茎叶疯长，水草容易露出水面，提早开花，这时需要人工去割草头。因此，最新的技术是状根控茎叶。最新的技术是含有微量元素、生物肽等壮根因子的产品，这样才能让水草的根系发达、并能提升水草的抗逆性，尤其高温天气防止其衰老速度。
对于水草活力不好的，可以第四天的时候，丰富水体中的微量营养元素、糖类和促水草生长因子等，可以快速恢复水草活力，促进水草根茎叶的生长，可使水草迅速度过老化、换季期；
对于水草上泥垢后期，已经开始有纤毛虫和青苔附着在草上，此种情况就稍微难处理，经过以上方案处理，在第二天的时候（情况严重可以适当配合少量硫酸铜使用）先把纤毛虫和青苔杀灭、抑制住，然后在进行后续的处理，效果是非常明显的。
另外，使用以腐植酸为主要成分的药物，配合EM菌一起处理单纯的水草污垢，效果依然比较理想。
五、水质过肥
进入六月份，温度慢慢升高，适当的补肥有助于提高水体稳定性，减少水产养殖动物应激反应。但是由于大部分养殖户前期底肥比较多，而补肥选择的产品不当，很容易把水一次性肥的过浓，透明度低，有机质丰富，草上很开容易附着藻类、细菌等，增加了水草附着泥垢的能力，水草在多方影响下，渐渐腐烂死亡。
应对措施：通常在水质刚刚肥起来的时候就要及时处理，首先使用改底制剂分解有机质，杀灭部分藻类，连续加量使用两次芽孢杆菌，可迅速提高水体透明度。
芽孢杆菌的作用已被公认。但是，我们在使用时经常发现不同的产品会有不同的效果。有的产品用量少效果好，有的即使大量使用也不见效。为什么呢？因为微生物制剂核心技术在于菌种的好坏和菌种的数量。很多养殖户误认为重量多数量就多。其实并非如此，先进的发酵技术和制剂技术可以使每克产品中的菌总数量达到500亿以上。一般的小厂家受制于技术和设备的制约很难达到。同时菌种的好坏更是决定了产品的使用效果。芽孢杆菌是带有孢子的杆菌总称，芽孢杆菌的种类多达上百种。有的适合人类肠道，有的适合水质改良，有的适合垃圾处理。也就是说并不是所有的芽孢杆菌都适合水产养殖。因此，建议大家在选择产品的时候选择高含量的产品，因为只有大厂家才能做出高含量的产品，同时他们也会在菌种库当中选择适合水产养殖的菌种进行生产。
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